Buenos días,
Al parecer lo que tienes es un problema en el ventilador, pero no me refiero a que el ventilador de la cpu esté roto o funcione mal, sino que lo que comentas es síntoma de que se ha soltado algún cablecito (posiblemente se ha despegado algún adhesivo) y ahora te rebota en el ventilador hasta que se engancha en algún sitio y deja de hacer ruido.
Lo primero que se me ocurre sería desmontar las tapas traseras donde están los ventiladores (posiblemente se puedan sacar con un par de tornillos sin desmontar todo el portátil) y revisar si es el caso, sino tendremos que profundizar un poco más o incluso grabar el sonido para ver exactamente el ruido que es.
Un saludo